Ingénieur Bioinformaticien en Analyse de Transcriptome et de Traductome H/F - CNRS

Description du Poste Les Missions Analyse de données de transcriptome et de traductome et mise en place d'une ressource en ligne pour la recherche en immunologie. L'Activité - Mettre en place des pipelines Unix d'analyse de données NGS- Comparer des données transcriptome/traductome de différents tissus - Assurer le respect des principes FAIR des procédures informatiques- Déployer et assurer la maintenance de services bioinformatiques en ligne sur différentes plateformes (cluster local, cloud, serveurs web) Votre Profil Compétences - Connaissance des outils et concepts utilisés en analyse NGS (genome/transcriptome/proteome)- Maîtrise des langages Python et R- Maîtrise d'au moins un gestionnaire de workflow- Production de conteneurs Linux (Docker, Singularity)- Bonne pratique de la maintenance de code et de la gestion de versions- Anglais niveau B1- Sens du relationnel et de la communication- Curiosité, dynamisme,- Capacité à gérer de nombreuses interactions et à travailler sur des projets variés. Votre Environnement de Travail Dans le cadre d'un projet financé par l'Agence de Recherche sur le Cancer (ARC) avec l'institut Curie et l'INSERM, nous étudions le transcriptome et le traductome de l'épithélium thymique, un tissu essentiel qui permet la reconnaissance du soi et du non-soi par le système immunitaire. L'ingénieur.e en bioinformatique sera en charge du traitement et de l'analyse des données NGS générées. Il/elle appliquera notamment des méthodes d'analyse sans référence, pour identifier toute la diversité des antigènes produits par ce tissu, puis comparer cette diversité à celle des autres tissus normaux. Nous exploiterons ces données pour déterminer si des antigènes de tumeur sont effectivement specifiques des tumeurs. Enfin, nous mettrons ces données à disposition de la collectivité via un service web.L'I2BC est un grand institut de biologie moléculaire et cellulaire situé dans un cadre très agréable à 25km de Paris (Gif sur Yvette). Notre équipe (Biologie computationnelle des génomes) fait partie du département de Biologie des Génomes. L'environnement bioinformatique local est très riche: forum de discussion, séminaires et formations en bioinformatique, plateforme bioinformatique et centre de calcul de haute performance. Rémunération et avantages Rémunération entre 2571 et 2742 euros bruts mensuels selon expérience Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR9198-JUDELV-007 Secteur d'activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en traitement de donnees (H/F) À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche