ou un Assistant Ingénieur en Microbiologie H/F - 78

Mission :

L'équipe Biologie des Systèmes Bactériens et Résistance aux Antibiotiques est une équipe récemment installée au LBPA. Elle combine microscopie quantitative, microfluidique, microbiologie moléculaire et modélisation mathématique pour comprendre comment les bactéries répondent à l'exposition aux antibiotiques. Nous nous concentrons principalement sur l'espèce Escherichia coli et sa réponse aux antibiotiques qui endommagent l'ADN.

Le/La candidat(e) sera impliqué(e) dans un projet qui vise à mieux comprendre la réponse d'Escherichia coli a des doses sub-léthales d'un antiobiotique qui provoque des cassures double-brin de l'ADN, la ciprofloxacine. Nous travaillons à la fois avec des souches d'E. coli commensales (K12) et des souches pathogènes qui peuvent conduire à une infection urinaire (uropathogène, UPEC).Pour mieux comprendre la réponse à la ciprofloxacine nous utilisons de la microscopie à haute résolution pour suivre en temps réel la réparation de l'ADN. Nous avons montré que l'efficacité de cette réparation dépend des conditions de croissance de la population bactérienne. Le/la candidat(e) testera l'efficacité de réparation dans différents milieux de croissance et mettra en place l'utilisation d'une puce de microfluidique que nous avons déjà developpée. Il/elle sera aussi amené(e) à observer la réparation de l'ADN par microscopie.

Activités principales :
- Cultures bactériennes d'Escherichia coli commensale
- Construction de souches bactériennes utilisant des outils de «genome editing»
- Microscopie en fluorescence et utilisation de microfluidique
- Construction de souches bactériennes